Projet présenté par Sophie Le Poder Pr en virologie ENVA, lors de l'assemblée générale du LOOF du 15 juin 2019. Financement par AGRIA sur deux ans (budget 10.953 € HT).
Objectif: étudier comment apparaissent les cas de PIF en élevage.
Les virus FeCV (coronavirus bénins) et FIPV (coronavirus pathogènes responsables de la PIF) sont très semblables, ils diffèrent probablement sur 2 gènes, (gène S et gène ORF3c).
Méthode/Protocole
- Un questionnaire sera envoyé aux éleveurs pour mieux connaitre l’incidence de la PIF en élevage.
- Recrutement de 2 élevages volontaires (si possible un élevage sans cas de PIF et un élevage avec des cas de PIF).
- Suivi mensuel sur 2 ans de la circulation des souches FCoV par écouvillon rectal (en particulier sur chatte reproductrice et chatons),
- Suivi de l’excrétion virale fécale chez les animaux au cours du temps,
- Caractérisation génétiques des souches virales circulantes (en collaboration avec le Dr M. Le Gouil, université de Caen)
Planning des recherches :
La 1ère année :
- Envoi du questionnaire aux éleveurs
- Sélection d’au moins deux élevages volontaires
- Envoi mensuel de selles des animaux de l’élevage vers l’UMR 1161 Virologie/ENVA
- Evaluation par RT-qPCR de la présence du coronavirus félin chez les différents animaux
- Présentation au conseil scientifique du LOOF des données en cours obtenus/rapport d’étape
La 2ème année :
- Séquençage par la technologie SANGER des gènes S et ORF3c
- Séquençage haut-débit et analyses des quasi-espèces virales au cours du temps sur une sélection de prélèvements d’animaux, en priorité ceux ayant déclaré une PIF
- Présentation au conseil scientifique du LOOF des données obtenus, publication scientifique
Les résultats attendus :
- Incidence de la PIF en élevage félin (via les résultats du questionnaire)
- Une première caractérisation moléculaire fine en prospective des souches FCoV, en amont des cas de PIF
- Une étude pilote pour déterminer quel est le scénario le plus probable expliquant la survenue de cas de PIF en élevage
- Conseils de prophylaxie sanitaire pour minimiser les risques d’apparition de cas de PIF
